Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms