Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMDSO60547 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMDSO60547 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMDSO60547 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms