Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN3BO60391 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms