Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms