Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP9O43818 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRP9O43818 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms