Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HTATSF1O43719 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTATSF1O43719 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms