Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATCO43716 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATCO43716 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms