Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXA3O43365 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms