Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SRGAP3O43295 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP3O43295 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms