Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SART1O43290 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SART1O43290 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SART1O43290 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SART1O43290 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SART1O43290 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SART1O43290 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SART1O43290 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SART1O43290 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SART1O43290 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SART1O43290 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SART1O43290 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms