Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1CO15160 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR1CO15160 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms