Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP290O15078 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP290O15078 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms