Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCF2LO15068 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCF2LO15068 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCF2LO15068 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms