Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PITPNM1O00562 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNM1O00562 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms