Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms