Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
I3L3M4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
I3L3M4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
I3L3M4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
I3L3M4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
I3L3M4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
I3L3M4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
I3L3M4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
I3L3M4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms