Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf229H3BNL8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms