Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HHLA1C9JL84 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHLA1C9JL84 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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