Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN25C9JDP6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms