Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DEV8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DEV8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DEV8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DEV8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms