Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms