Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms