Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC69A6NI79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms