Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOPA6NHQ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOPA6NHQ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms