Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms