Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms