Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMB4A4D0S4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms