Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms