Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AL008718.1-201ENST00000445867 487 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL020996.1-202ENST00000453649 517 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RN7SL151P-201ENST00000460537 283 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DMKN-219ENST00000461300 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RN7SL419P-201ENST00000471592 287 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DMKN-239ENST00000474928 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC078814.1-201ENST00000484568 645 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DMKN-253ENST00000488892 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AP001880.1-201ENST00000538772 421 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 IZUMO3-202ENST00000543880 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MIR4269-201ENST00000578705 84 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC032019.1-201ENST00000579100 173 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC103809.1-201ENST00000585167 651 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 OR52R1-201ENST00000624978 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LINC00595-209ENST00000634389 549 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL117339.1-203ENST00000638066 888 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC012613.2-201ENST00000523176 4533 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LEO1-202ENST00000315141 1981 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TMEM241-201ENST00000383233 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC091962.1-201ENST00000561496 1765 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SEMA6A-201ENST00000257414 4256 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PSG5-205ENST00000404580 2145 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MIR4697HG-201ENST00000624667 5164 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TXLNGY-203ENST00000445715 1915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CRYZL1-201ENST00000290244 1685 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CYP19A1-204ENST00000405913 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 NDUFB4-203ENST00000485064 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 C20orf197-201ENST00000625080 2732 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CLUAP1-203ENST00000572600 2221 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ICA1-205ENST00000401396 1742 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 GIMAP5-201ENST00000358647 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CCDC65-202ENST00000320516 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AKNAD1-201ENST00000369994 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 FMN1-203ENST00000558197 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MIR646-201ENST00000385067 94 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC069281.1-201ENST00000392471 570 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC092431.1-201ENST00000415342 420 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 PGM5P4-AS1-203ENST00000446595 739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC073336.1-201ENST00000448767 664 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC104212.1-201ENST00000472088 613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RN7SL461P-201ENST00000484915 282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CCDC169-210ENST00000491049 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 NUDT19P5-201ENST00000505620 569 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC090519.1-201ENST00000508195 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AF250324.1-202ENST00000511785 979 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC138646.1-201ENST00000519983 633 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC105109.1-201ENST00000556012 1115 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DPPA5P2-201ENST00000561451 299 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.121-201ENST00000578843 303 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 NOS2P4-201ENST00000582696 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC005828.4-201ENST00000584608 552 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TP53TG1_1.1-201ENST00000612852 152 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SLC25A15P4-201ENST00000614260 289 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RN7SL627P-201ENST00000620534 303 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC022400.7-201ENST00000625041 1236 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AL360294.1-201ENST00000640945 2438 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AGXT2-204ENST00000510428 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RFLNB-201ENST00000329099 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 HMGCLL1-205ENST00000398661 2532 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 AC063949.2-201ENST00000508671 1968 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 NFYC-211ENST00000427410 1379 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ZNF550-206ENST00000506609 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 LINC01266-201ENST00000420823 3948 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 FAM180A-201ENST00000338588 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 SPECC1-205ENST00000395529 4971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 DMP1-201ENST00000282479 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 MRPL48-202ENST00000314282 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LMO3Q8TAP4 BLACAT1-201ENST00000626538 2994 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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