Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMTA1Q9Y6Y1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms