Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC61Q9Y6R9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms