Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL42Q9Y6G3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms