Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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SNX13Q9Y5W8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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SNX13Q9Y5W8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SNX13Q9Y5W8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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