Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms