Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms