Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms