Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUPT16HQ9Y5B9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms