Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMM50Q9Y512 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMM50Q9Y512 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms