Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms