Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG6Q9Y2V7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG6Q9Y2V7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms