Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCQ9Y266 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms