Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM50BQ9Y247 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms