Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms