Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDZRN3Q9UPQ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms