Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms