Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PHF8Q9UPP1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms