Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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