Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALKQ9UM73 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALKQ9UM73 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms