Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms