Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF608Q9ULD9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF608Q9ULD9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms